La construcción del ferrocarril se inició en el gobierno de Gabriel García Moreno, quien en 1873, pone al servicio del Ecuador 41 Km. de vía, desde Yaguachi hasta Milagro, en la CostaEn 1895, con el triunfo de la Revolución Liberal, la obra fue retomada por el General Eloy Alfaro Delgado En 1897 se constituye la compañía The Guayaquil and Quito Railway Company e inician los trabajos de construcción del Ferrocarril del Sur. En 1902 en el cerro conocido como “Cóndor Puñuna o Nido del Cóndor” se construyó La Nariz del Diablo, una obra de ingeniería que por su complejidad, motivó la denominación del “Tren más difícil del Mundo”En 1905 se inaugura el tramo Durán-Riobamba En 1906 llega el tren a la ciudad de Ambato El 25 de junio llega por primera vez el tren a Chimbacalle y se finaliza la obra Quito-Guayaquil con el presidente Eloy Alfaro y los hermanos Harman. En 1912 se inaugura el tramo Bahía-Chone.En 1928 se inaugura el tramo Santa Rosa-El Oro. En 1929 se inaugura el tramo Quito-Ibarra con la presencia del Presidente Isidro Ayora. En 1936 se inaugura el tramo Guayaquil-Salinas El 26 de agosto de 1957, en el Gobierno de Camilo Ponce Enríquez, se inaugura el tramo Ibarra-San Lorenzo. Las provincias de la Sierra lograron salida al océano Pacífico y acercaron al país al centro comercial más grande del mundo: el Canal de Panamá.
En 1965 se inaugura el tramo Sibambe-Cuenca. Inicia la decadencia del Ferrocarril por su competencia con el transporte de carretera y falta de interés de los gobiernos En un intento por recuperar el Ferrocarril en el gobierno de Rodrigo Borja se compraron locomotoras electrodiesel, sin lograr su cometido Se pierde el tramo del río Chanchán por el Fenómeno del Niño.1 de abril de 2008, el Instituto Nacional de Patrimonio Cultural (INPC) declara como bien perteneciente al Patrimonio Cultural del Estado a la Red Ferroviaria del Ecuador “Monumento Civil y Patrimonio Histórico, Testimonial, Simbólico”. En este año inicia el proceso de rehabilitación del Ferrocarril Ecuatoriano como un proyecto emblemático del gobierno del Eco. Rafael Correa Delgado El 30 de diciembre de 2008 se reinaugura el tramo Quito-Latacunga. El 15 de abril de 2009 se reinaugura el tramo El Tambo-Coyoctor El 29 de junio de 2010 se reinaugura el tramo Durán-Yaguachi. El 16 de febrero del 2011 se reinaugura el tramo de la Nariz del Diablo Alausí-Sibambe. La Estación Eloy Alfaro de Chimbacalle es elegida como la primera de las 7 Maravillas de Quito.
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